Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms