Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSNK2BP67870 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms