Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNRPNP63162 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNRPNP63162 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms