Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEMP55040 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEMP55040 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEMP55040 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEMP55040 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GEMP55040 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GEMP55040 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GEMP55040 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GEMP55040 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GEMP55040 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GEMP55040 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GEMP55040 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GEMP55040 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GEMP55040 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GEMP55040 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms