Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOSBP53539 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOSBP53539 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOSBP53539 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOSBP53539 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOSBP53539 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOSBP53539 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOSBP53539 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOSBP53539 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOSBP53539 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms