Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACLYP53396 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACLYP53396 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACLYP53396 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACLYP53396 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACLYP53396 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACLYP53396 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACLYP53396 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACLYP53396 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACLYP53396 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACLYP53396 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms