Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DAP3P51398 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DAP3P51398 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms