Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERFP50548 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms