Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IDH3AP50213 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IDH3AP50213 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms