Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARCN1P48444 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms