Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRATP43155 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRATP43155 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRATP43155 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms