Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIA2P42262 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms