Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms