Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB4P28070 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB4P28070 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms