Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PTPRBP23467 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRBP23467 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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