Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms