Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM10L2BP0DMW5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms