Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms