Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms