Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCG5P05408 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCG5P05408 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCG5P05408 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms