Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PDE6DO43924 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PDE6DO43924 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms