Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PHOX2AO14813 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PHOX2AO14813 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PHOX2AO14813 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PHOX2AO14813 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PHOX2AO14813 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PHOX2AO14813 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms