Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCRL2O00421 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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