Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms