Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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SNX13Q9Y5W8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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