Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AFG3L2Q9Y4W6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms