Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms