Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NKX1-2Q9UD57 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms