Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHRF1Q9P1Y6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms