Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLCO1B3Q9NPD5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms