Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XKR8Q9H6D3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms