Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTDSS2Q9BVG9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms