Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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KCNS3Q9BQ31 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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KCNS3Q9BQ31 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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KCNS3Q9BQ31 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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KCNS3Q9BQ31 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNS3Q9BQ31 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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