Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SH3GL3Q99963 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms