Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PGLYRP3Q96LB9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms