Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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EP400Q96L91 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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EP400Q96L91 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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EP400Q96L91 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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EP400Q96L91 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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EP400Q96L91 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EP400Q96L91 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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