Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms