Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNFT2Q96EX2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms