Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms