Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NXNL1Q96CM4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms