Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FAM3DQ96BQ1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3DQ96BQ1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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