Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB13Q92826 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms