Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BHLHE22Q8NFJ8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms