Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms