Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC141Q6ZP82 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms