Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZCCHC12Q6PEW1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms