Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms