Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP170Q5SW79 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms