Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PERM1Q5SV97 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PERM1Q5SV97 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms