Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ISXQ2M1V0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms